Zakład Mikrobiologii Ogólnej powstał w 2005 roku po połączeniu Zakładu Mikrobiologii Środowisk (kierowanego pierwotnie przez prof. Romana Mycielskiego, a potem przez prof. Mieczysława Błaszczyka) oraz Zakładu Fizjologii Bakterii (kierowanego pierwotnie przez prof. Zbigniewa A. Kwiatkowskiego, a potem przez prof. Zdzisława Markiewicza). Kierownikiem nowego Zakładu Mikrobiologii Ogólnej został prof. Z. Markiewicz. Od września 2007 roku obowiązki Kierownika pełni dr Magdalena Popowska. W maju 2009 roku Zakład Mikrobiologii Ogólnej stał się częścią Zakładu Mikrobiologii Stosowanej tworząc Grupę Badawczą Mikrobiologia Ogólna.
      W obrębie Grupy Badawczej Mikrobiologia Ogólna istnieją dwie jednostki, realizujące odrębną tematykę jak i również wspólne projekty. W obu grupach tematyka prac licencjackich i magisterskich jest związana z aktualnie realizowanymi projektami badań. Prace licencjackie mają charakter opracowań monograficznych na podstawie aktualnych, anglojęzycznych, oryginalnych publikacji i z reguły stanowią teoretyczny wstęp do późniejszych prac magisterskich. Tematem prac magisterskich są zazwyczaj zagadnienie badawcze, stanowiące część dużego projektu, realizowanego przez daną grupę badawczą, której członkiem jest promotor danego magistranta.